Από το έτος ίδρυσής του μέχρι το 1996 διευθυντής του Ζωολογικού Μουσείου ήταν ο Καθηγητής κ. Ι. Όντριας. Έκτοτε το Μουσείο διευθύνεται από Επιστημονική και Διαχειριστική Επιτροπή, την οποία έχουν στελεχώσει τα εξής μέλη ΔΕΠ του Τομέα Βιολογίας Ζώων:

• Κασπίρης Παναγιώτης, Καθηγητής (1997 - 2008)
• Σταματόπουλος Κων/νος, Λέκτορας (1997 - 2007)
• Γιαγιά-Αθανασοπούλου Ευαγγελία, Καθηγήτρια (1997 - 2013)
• Φραγγεδάκη-Τσώλη Στέλλα, Καθηγήτρια (1997 - 2013)
• Χονδρόπουλος Βασίλειος, Καθηγητής (1997 - 2014)
• Γκιώκας Σίνος, Αναπληρωτής Καθηγητής (2015 - )
• Μαργαρίτη Μαριγούλα, Αναπληρώτρια Καθηγήτρια (2015 -)
• Μήτσαινας Γεώργιος, Λέκτορας (2015 - )
• Τζανάτος Ευάγγελος, Επίκουρος Καθηγητής (2015 - )